简介：天才脑科学家白月魁，为救恩师霍恩进行了脑移植术，却不想受到将霍恩大脑所植入躯体的原主人西弗残存意识的影响……霍恩曾经的学生琼斯盗取了天使再生剂注射到19号实验体上引起了一系列异变。
同一时间，久川市因为瘟疫感染变成了一片人间炼狱，市长白靖宇和人工智能ASH为了抵御联盟的入侵誓死不降，却不想等到一切尘埃落定之死，真正的末日玛娜生态却来临了……在表面安宁的nirvana养老院内．nirvana涅槃生物公司在市长白靖宇的授意下，秘密进行着奇迹K（天使药剂）的人体实验。
在一个风和日丽的白天，一位后颈部标着19号的抱着白猫的暮年老人被注射一剂蓝色药剂。
当然，为掩人耳目，这一切都是在养老院废弃的地库中进行的。
老人注入天使药剂后，年迈的身躯变化为一具年轻的躯体，但令实验负责人愤怒的是：19号实验体的大脑仍是老年人的大脑，于是宗其斤下令加大天使药剂的剂量，19号实验体开始体温升高，身体也产生了异化，最终破开实验室的禁锢，坠入大海。
在饱受争议的换脑技术发布会后，主讲人白月魁的恩师霍恩教授除大脑外，身体机能严重受损，白月魁欲冒着陪违规手术的罪名，将霍恩教授的大脑进行移植，从而复活这位待白家兄妹如自己儿女的恩师，哥哥白月天从牢狱中寻得死刑犯西弗的尸体。
西弗曾给久川市警察局局长带来沉重灾祸，不仅使格雷局长身体残疾，成为"钢铁侠"，还奸杀格雷的妻子，给儿子格兰留下心理阴影。
格雷在白塔监狱折磨着这个让他恨之入骨的死刑犯，警员白月天一枪正中西弗眉心，并将西弗的遗体秘密运至久川市医院白月魁的手术室，顾不得查明遗体身份，白月魁便开始了换脑手术，手术过程中霍恩教授曾极力阻止，并在取出大脑后低语道：规则将毁，循环将破；轮回即断，大门己关。
苏醒后的霍恩教授饱受着西弗这具罪恶躯体的侵蚀，甚至被西弗主导躯体后曾差点掐死白月魁。
与此同时吸入地蔓藤孢子的民众开始变异成面目可憎，感染病毒的感染者，他们大批涌入医院，医院变得人满为患。
白月天也在此阶段查处了人口贩卖的基地"乐园"，上帝视角的观众还得知背后主使人竟是久川市的副市长卡米拉。
19号实验体被海浪冲至岸边，遭受混混们的虐打，最终狂欢场爆发地蔓藤，它绽放玛娜之花并将19号实验体吸入其中。
本想出门闲逛的霍恩教授在西弗躯体的控制下误入地下酒吧。
被正在此过18岁生日的格兰发现，童年阴影的应激下，格兰开始殴打霍恩教授，还召集众损友群殴他，手无缚鸡之力的霍恩教授很快昏了过去，失去身体控制权后强悍的西弗主导躯体后，残忍虐杀了地下酒吧的客人和工作人员共78人，当格雷局长赶到现场后，他唯一的血亲格兰己惨死酒巴。
格雷愤怒到了极点，正当要结果失去意识的霍恩教授时，白靖宇的专属护卫机器人制止了格雷的暴行，随后白靖宇市长的亲临更是让气氛跌到了冰点，一阵言语交锋后，白靖宇占到上风，将昏迷的霍恩教授押入监狱。
同时，ASH又将白月魁换脑手术的视频传到了久川市的每一块屏幕上，引发市民的热议。
避之不及的白魁在动车上与少数具有正义感的市民与异变成类似《灵笼》正传花萼兽的19号实验体展开搏斗，正当动车脱轨，白月魁将坠亡时，白月天驾驶着警车接住了白月魁，在兄妹俩将战胜19号实验体时，白靖宇与格雷赶至现场将白家兄妹中的妹妹白月魁羁押至监狱，并将19号实验体放在附近的核电站，派武警看守。
离开医院的白月天找到白靖宇，了解到父亲己在兄妹二人离家出走时自尽，ASH将白靖宇的意识上传到仿生人中，成为了现在的白靖宇。
白月天了解了白父的心路历程，与他抱头痛哭，并深入久川市地下向靖宇所建的秘密研究所，了解到了父亲曾接受过高维生命的神祇，内容和霍恩教授的呓语"规则将毁，循环将破；轮回即断，大门己关。
"惊人地一致。
与此同时，白靖宇还与联盟存在的积蓄己深的战争侵占隐患。
联盟的西方势力中，海拉帝国对久川市的ASH技术垂涎己久，迫于西方压力，白靖宇被迫接受了联盟将久川市划分为ASH万物互联网特别实验区，以避免玛娜生态向外扩散。
联盟还敦促白靖宇加快对ASH升级的技术研究，尽快将ASH技术共享给联盟的西方势力，而对久川市所爆发的玛娜危机熟视无睹。
画面一转，来到格雷局长亡妻诺薇的墓前，格雷局长来和亡妻的意识实体聊天，以填补他万念俱念的空心。
当谈到痛失的爱子格兰时，妻子的意识实体也消散，格雷局长在亡妻的墓前发誓，定要予霍恩教授和白月魁最严厉的制裁。
庭审前，白靖宇特邀负责地下酒吧虐杀案的"铁面法官"洛特斯会晤，当白靖字以市长名义升洛特斯为久川市大法官时，洛特斯仍坚持他公正的原则，即便白月魁能救他弥留之际的女儿。
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